CB125R kompaktais 124,9cc DOHC 4 vārstu šķidrumdzeses viencilindra motors ir veidots, lai sniegtu pietiekamu atsaucību reālos braukšanas apstākļos.

Ar degvielas patēriņu 45,5 km/l (WTMC metode), CB125R spēj nobraukt vairāk nekā 460 km ar vienu bāku.